Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSU1Q15404 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSU1Q15404 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms