Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRF4Q15306 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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