Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABEP1Q15276 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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