Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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BRD3Q15059 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRD3Q15059 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
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