Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD6Q15008 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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