Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SEMA3AQ14563 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SEMA3AQ14563 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SEMA3AQ14563 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SEMA3AQ14563 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SEMA3AQ14563 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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