Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms