Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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