Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLF9Q13886 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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