Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA3CQ13748 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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TUBA3CQ13748 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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TUBA3CQ13748 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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TUBA3CQ13748 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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