Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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CDH18Q13634 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH18Q13634 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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