Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
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