Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRR1Q13601 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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