Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF4BQ13523 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms