Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SP140Q13342 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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SP140Q13342 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SP140Q13342 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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SP140Q13342 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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SP140Q13342 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SP140Q13342 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SP140Q13342 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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SP140Q13342 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SP140Q13342 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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SP140Q13342 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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SP140Q13342 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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SP140Q13342 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SP140Q13342 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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SP140Q13342 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SP140Q13342 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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SP140Q13342 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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