Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SKP2Q13309 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKP2Q13309 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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