Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM28Q13263 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM28Q13263 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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