Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3BQ13214 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3BQ13214 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms