Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ECH1Q13011 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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