Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HSPB3Q12988 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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