Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNTN1Q12860 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNTN1Q12860 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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