Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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KCNH2Q12809 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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KCNH2Q12809 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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KCNH2Q12809 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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KCNH2Q12809 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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KCNH2Q12809 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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KCNH2Q12809 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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KCNH2Q12809 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNH2Q12809 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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KCNH2Q12809 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNH2Q12809 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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