Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
GOLGA3Q08378 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms