Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR1Q08345 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms