Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOS1Q07889 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOS1Q07889 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOS1Q07889 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SOS1Q07889 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOS1Q07889 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOS1Q07889 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOS1Q07889 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOS1Q07889 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms