Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL16A1Q07092 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL16A1Q07092 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms