Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNDQ07001 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNDQ07001 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms