Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAD51Q06609 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms