Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB1Q02818 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms