Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APBA1Q02410 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms