Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN7AQ01118 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN7AQ01118 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms