Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRCDQ00LT1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRCDQ00LT1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms