Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms