Protein–RNA interactions for Protein: Q008S8

ECT2L, Epithelial cell-transforming sequence 2 oncogene-like, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECT2LQ008S8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECT2LQ008S8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECT2LQ008S8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms