Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDLBPQ00341 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms