Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VLDLRP98155 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms