Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKOR1P84550 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms