Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMF1P82094 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMF1P82094 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMF1P82094 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMF1P82094 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMF1P82094 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMF1P82094 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMF1P82094 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMF1P82094 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMF1P82094 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMF1P82094 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMF1P82094 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMF1P82094 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms