Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP2P81877 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms