Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB4BP68371 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms