Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11AP62491 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms