Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF6P62330 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF6P62330 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF6P62330 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms