Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE2HP62256 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms