Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPZ1P61923 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPZ1P61923 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms