Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVS71-1P61550 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms