Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFC1-1P60608 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms