Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCCD1P59942 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms