Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL3P58215 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms