Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP12AP54707 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP12AP54707 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms