Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACLYP53396 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACLYP53396 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACLYP53396 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACLYP53396 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACLYP53396 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms